信息安全系是學院為適應信息安全發展需要、突出學院特色而新開辦的一個系，將為國家培養具有密碼特色、從事信息安全領域研究、管理與應用開發的高素質人才。信息安全系主要承擔全院密碼、信息安全課程的教學工作，并承擔全院密碼學科的建設工作。

設有密碼教研室，信息安全教研室，信息安全實驗室和密碼應用教學基地，根據科研工作的需要，分別設立了密碼理論與應用技術研究室，信息安全技術研究室和信息隱藏技術研究室。全系擁有教師 24名。其中，教授4 人，副教授2 人，高級工程師1人，主任科員1人，講師 13人，助教 3人;青年教師均具有碩士以上學歷，5人具有博士學歷。1人獲得國務院頒發的政府特殊津貼，2人榮立全國黨政密碼系統一等功，4人被西安電子科技大學遴選為碩士研究生合作導師。