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學院設有中德工程學院、軟件與服務外包學院、電氣工程學院、現代港口與物流管理系、生物與化學工程系、應用外語系、藝術設計系、職業素質教育中心、聯合研究院、繼續教育學院等10個教科研單位，與地方政府、行業企業聯合建設江蘇省太倉大學科技園、國家級高校學生科技創業實訓基地、太倉市企業聯合大學等服務平臺。
契合區域產業發展需要設置專業20多個。其中央財支持專業2個(物流管理、機電一體化技術)、省級品牌1個(機電一體化技術)、特色專業1個(機電一體化技術)、省級重點專業群2個(機電一體化技術專業群、信息技術服務外包專業群)、蘇州市優秀新專業1個(工業分析與檢驗)，建有央財支持實訓基地2個(計算機應用與軟件技術實訓基地、電氣自動化技術實訓基地)、省級實訓基地3個(數控實訓基地、國際服務外包人才培訓基地、中德機電“雙元制”工程中心)、省級人才培養模式創新實驗基地1個(“定崗雙元”高職人才培養模式創新實驗基地)。
